Au second empire, le baron Haussmann refuse une nouvelle fois de la détruire alors que le ministre d'état et de la maison de l'empereur, Achille Fould le lui suggére. En effet, après démolition des vieux immeubles délabrés qui l'entourent, un vaste espace se dégage face à la colonnade du Louvre et l'église se retrouve posée de travers sur un des cotés, donnant un air inesthétique à l'ensemble. Cependant, en tant que protestant, le baron ne veut pas qu'on lui reproche d'avoir détruit le symbole qui avait donné le signal de la Saint-Barthélémy. Il développe alors un projet pour équilibrer le tout : il demande à l'architecte Jacques Hittorff de construire un édifice jumeau pour la mairie du 1er arrondissement. Entre les deux, il fait construire un campanile (ou beffroi) de style gothique flamboyant édifié entre 1858 et 1863 par l'architecte Théodore Ballu, Prix de Rome en 1840. L'ensemble réalisé fut parfois jugé trop symétrique, au point d'être comparé à "un huilier et ses deux burettes". Vu de l'extérieur, il est impossible de différencier la mairie de l'église.